Directory dapat diibaratkan sebagai map/wadah yang berisi folder dan file-file yang disimpan di dalamnya. Directory juga bisa diibaratkan sebagai lemari pakaian, semua file yang dibuat adalah pakaian, dan folder adalah laci lemari yang digunakan untuk menyimpan semua pakaian tadi. Bayangkan, jika kita tidak memiliki lemari dengan laci-laci, maka semua pakaian akan bertumpuk begitu saja, sehingga terlihat berantakan dan tidak rapi.

Directory digunakan untuk mempermudah pengelompokkan file-file dan directory. File-file dan directory yang ada harus dikelompokkan dan diorganisasikan dengan baik sehingga jika kita membutuhkan data-data/file tertentu kita dapat mencari dan mendapatkannya dengan mudah.  folder adalah tempat untuk menyimpan file. Setiap file dalam hierarki suatu directory dapat dispesifikasikan berdasarkan nama jalur (path name) hierarki tertinggi suatu directory. Untuk mendapatkan keberadaan sebuah file, directory bersifat mutlak. Directory berisi nama file, jenis file, alamat di disk dimana file disimpan, dan ukuran file saat ini. Directory juga berisi informasi tentang perlindungan file, dan mungkin juga berisi informasi ketika file diciptakan dan ketika itu terakhir dimodifikasi.

Satu directory dapat berisi subdirectory banyak. Selanjutnya, subdirectory dapat berisi subdirectory sendiri, sehingga menciptakan struktur hirarki.Oleh karena itu, sistem file sering dipandang sebagai pohon directory, menampilkan directory dan file directory dalam lainnya.Directory pada tingkat tertinggi disebut directory root.

Sebuah directory dan folder adalah hal yang sama. Folder Windows di drive C:\Windows adalah hal yang sama seperti C:\Windows di MS-DOS. Oleh karena itu, benar-benar tidak ada perbedaan antara keduanya, selain dari penamaannya. Namun, ketika mengacu pada antarmuka baris perintah seperti MS-DOS atau Linux itu lebih tepat dikatakan directory bukan folder. Dalam antarmuka pengguna grafis (GUI), seperti Windows, itu lebih tepat dikatakan folder bukan directory. Cara mudah untuk mengingat aturan ini adalah bahwa ketika melihat folder dan file pada Windows folder akan memiliki gambar folder, seperti yang ditunjukkan pada gambar. Dalam baris perintah, tidak ada gambar folder.

Path adalah istilah yang digunakan untuk menunjukkan alamat dari sebuah file. Suatu path biasanya terdiri dari drive tempat file berada, direktori yang dipakai, subdirektori dari file tersebut, dan nama file yang dicari. Path dibagi menjadi dua, yaitu Path Absolut dan Path Relatif. Path Absolut Atau disebut sebagai path file dan path lengkap adalah jalan yang berisi akar direktori dan semua sub direktori lain yang berisi file atau folder. Sedangkan sebuah path relatif adalah cara untuk menentukan lokasi direktori relatif ke direktori lain. Ketika dokumen pada drive yang sama seperti indeks, Search otomatis akan menggunakan path relatif untuk menyimpan lokasi dokumen.

File System adalah metode untuk menyimpan dan mengatur file-file dan data yang tersimpan di dalamnya untuk membuatnya mudah ditemukan dan diakses. File System dapat menggunakan media penyimpan data seperti HardDisk atau CD Rom. File System juga dapat melibatkan perawatan lokasi fisik file, juga memberikan akses ke data pada file server dengan berlaku sebagai klien untuk protokol jaringan (mis. NFS atau SMB klien), atau dapat juga berlaku sebagai file system virtual dan hanya ada sebagai metode akses untuk data virtual.

Fungsi File System salah satunya untuk memberi nama pada berkas dan meletakkannya pada media penyimpanan. Fungsi lainnya adalah sebagai konvensi penamaan berkas dan peletakkan berkas pada struktur direktori. Semua sistem operasi memiliki File Systemnya sendiri untuk meletakkan file dalam sebuah struktur hirarki.

File system merupakan interface yang menghubungkan sistem operasi dengan disk. Ketika program menginginkan pembacaan dari harddisk atau media penyimpanan lainnya, sistem operasi akan meminta file system untuk membuka file yang diminta tersebut.

File system akan mencari lokasi dari file yang diinginkan. Setelah file itu ditemukan, file system akan membaca file tersebut kemudian mengirimkan informasinya kepada sistem operasi dan akhirnya bisa kita dibaca.

Setiap sistem operasi memiliki system file yang berbeda-beda. Masing-masing sistem operasi memiliki keunggulan dalam system file-nya. Penamaan dalam Linux dan Windows pun berbeda. Karena sistem Windows ingin memudahkan pengguna maka sistem mereka mengubah nama menjadi nama yang lebih mudah bagi para pengguna. Penggunaan back slash (\) digunakan untuk memisahkan direktori-direktori dalam Windows, tetapi hal ini tidak ada dalam Linux.

Sistem Linux menggunakan case sensitive, yang artinya nama suatu file yang sama jika dibaca, tetapi penulisan namanya berbeda dalam hal ada satu file yang menggunakan huruf kapital dalam penamaan dan satu tidak akan berbeda dalam Linux. Contohnya ada file bernama filesaya.txt dan FileSaya.txt, jika dibaca nama filenya sama tetapi dalam Linux ini merupakan dua berkas yang jauh berbeda. Sedangkan sistem windows tidak menggunakan case sensitive. Jika file-file ini berada di sistem Windows, mereka menunjuk ke berkas yang sama.Karena perbedaan tipe sistem file tersebutitulah maka antara sistem operasi yang ada kadang-kadang tidak saling mengenal file yang dibuat oleh sistem operasi lain.

Beberapa kelemahan yang dimiliki exFAT antara lain:

b.    Mendukung sistem berkas terenkripsi secara transparan dengan menggunakan beberapa jenis algoritma enkripsi yang umum digunakan.

c.    Mendukung kompresi data yang transparan, meskipun tidak memiliki rasio yang besar, namun dapat digunakan untuk menghemat penggunaan ruangan harddisk.

d.   Mendukung hard link serta symbolic link seperti halnya sistem berkas dalam sistem operasi keluarga UNIX, meskipun dalam NTFS implementasinya lebih sederhana.

e.    Mendukung penamaan berkas dengan metode pengodean Unicode (16-bit UCS2) hingga 255 karakter.

f.     Memiliki fitur untuk menampung lebih dari satu buah ruangan data dalam sebuah berkas.

Pada Linux, seluruh program, dokumen, konfigurasi sistem-seluruhnya tersimpan di dalam file-file, sehingga di dalam hardisk anda dapat tersimpan ratusan atau bahkan ribuan file. Semuanya terorganisasi dalam sebuah sistem file (filesystem) Linux. Sistem file Linux berbeda dengan sistem file yang digunakan oleh sistem operasi lain seperti MS Windows atau Macintosh. Seluruh perangkat hard drive anda dipandang sebagai sebuah file. Linux menggunakan 3 tipe utama dari objek sebagai media penyimpanan informasi, yaitu :

Jenis-jenis system file pada Linux antara lain :

EXT2 adalah file sistem yang ampuh di linux. EXT2 juga merupakan salah satu file sistem yang paling ampuh dan menjadi dasar dari segala distribusi linux. Pada EXT2 file sistem, file data disimpan sebagai data blok. Data blok ini mempunyai panjang yang sama dan meski pun panjangnya bervariasi diantara EXT2 file sistem, besar blok tersebut ditentukan pada saat file sistem dibuat dengan perintah mk2fs. Jika besar blok adalah 1024 bytes, maka file dengan besar 1025 bytes akan memakai 2 blok. Ini berarti kita membuang setengah blok per file.

EXT2 mendefinisikan topologi file sistem dengan memberikan arti bahwa setiap file pada sistem diasosiasiakan dengan struktur data inode. Sebuah inode menunjukkan blok mana dalam suatu file tentang hak akses setiap file, waktu modifikasi file, dan tipe file. Setiap file dalam EXT2 file sistem terdiri dari inode tunggal dan setiap inode mempunyai nomor identifikasi yang unik. Inode-inode file sistem disimpan dalam tabel inode. Direktori dalam EXT2 file sistem adalah file khusus yang mengandung pointer ke inode masing-masing isi direktori tersebut.

Sistem Operasi Solaris milik Sun Microsystems pada rilis sebelumnya untuk melakukan tambahan sistem berkas dan proses booting di-default-kan pada UFS. Dukungan untuk sistem berkas lainnya dan perangkat tambahan yang signifikan telah ditambahkan dari waktu ke waktu, termasuk Veritas Software

VxFS , Sun Microsystems (Clustering) QFS , Sun Microsystems (Journaling) UFS, dan Sun Microsystems (open source, poolable, 128 bit compressible, and error-correcting) ZFS. Ekstensi kernel ditambahkan pada Solaris untuk memungkinkan operasi bootable Veritas VxFS. Logging atau Journaling ditambahkan ke UFS di Sun Solaris 7. Solaris 10 , Solaris Express, OpenSolaris , dan open source lain dari sistem operasi Solaris kemudian didukung bootable ZFS.

Logical Volume Management memungkinkan untuk mencakup sebuah sistem berkas di beberapa perangkat untuk tujuan menambah redundansi, kapasitas, dan/atau throughput. Legacy environtments di Solaris dapat menggunakan Solaris Volume Manager (sebelumnya dikenal sebagai Solstice DiskSuite). Beberapa sistem operasi (termasuk Solaris) dapat menggunakan Veritas Volume Manager . Solaris modern berbasis sistem operasi eclipse pada kebutuhan melalui Volume Management memanfaatkan kolam penyimpanan virtual dalam ZFS.

Atribut file digunakan oleh sistem operasi untuk memisahkan tipe-tipe file.

Atribut file adalah dimana sebuah file atau direktori bisa eksis atau sebuah file mempunyai atribut yang berbeda antara sistem operasi satu dengan yang lainnya. Atribut file digunakan oleh sistem operasi untuk memisahkan tipe-tipe file. Setiap file di windows mempunyai atribut tersendiri sesuai dengan kepentingan file tersebut terhadap sistem. Misalnya, tipe file yang tidak boleh dihapus oleh user diberi attribut system, jadi ketika file manager (windows explorer) akan menampilkannya, file beratribut sistem tersebut tidak akan ditampilkan.

File dengan atribut archive akan ditampilkan seperti file dengan atribut lain. Atribut ini berguna sebagai penanda bahwa file ini merupakan backup copy dari file yang asli.

File dengan atribut Hidden akah disembunyikan atau tidak ditampakkan secara langsung pada windows explorer. Kita harus merubah atributnya atau menyetel folder options untuk menampilkan file tersembunyi pada windows explorer. File dengan atribut hiden tetap dapat dibaca dan dirubah isinya (Read-Write).

File dengan atribut Read Only hanya dapat dibaca namun tidak dapat dirubah isi filenya sebelum kita menghilangkan atribut Read Only pada file tersebut. Atribut ini berguna untuk melindungi keaslian file agar tidak dapat dimodifikasi.

File dengan atribut system akan disembunyikan dengan prioritas yang lebih diutamakan daripada file dengan atribut hidden. File dengan atribut system dianggap sebagai file yang dibutuhkan untuk kelangsungan berjalannya sistem pada windows sehingga keberadaannya harus dilindungi/disembunyikan dengan aman agar tidak terhapus oleh user. File dengan atribut sistem sering juga disebut dengan super hidden.

CHMOD (change mode) yaitu sebuah tool untuk mengubah modus suatu file/folder. Biasanya untuk mengubah kepemilikan suatu file di linux digunakanlah chmod. Modus file/folder biasanya diwakili oleh simbol x (execute), r (read) dan w (write). Untuk direktory biasanya diwakili oleh simbol d (directory). Tiga digit dari simbol tersebut adalah untuk owner (pemilik), tiga digit berikutnya untuk group, dan tiga digit lainnya untuk other. Misalnya folder Linux memiliki atribut drwxr-x-rx maka dapat di artikan bahwa direktory/folder memiliki urutan kepemilikan dan hak akses sebagai berikut :

r=read dan x=execute saja

Keterangan :

read=dapat membaca/melihat

write=dapat memanipulasi/mengedit

execute=dapat menjalankan/eksekusi

Untuk mengubahnya dapat dilakukan menggunakan chmod dengan catatan anda adalah sebagai pemilik file dan seorang root (admin linux). Dapat pula dinyatakan sebagai simbol angka :

x 1

w 2

r 4

Contoh pada shell (command promt):

Eka-notix@linux$ chmod 766 eka.txt

Artinya:

7 = 4 + 2 + 1 = r + w + x (tiga digit pertama utk owner)

6 = 4 + 2 = r + w (tiga digit berikutnya utk group)

6 = 4 + 2 = r + w (tiga digit terakhir utk other)

Maka akan menjadi : rwxrw-r